① 《李秀成自述》，《太平天国》（二），页788。
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（三）起义准备：组织队伍，反对神权和绅权
与此同时，洪秀全和冯云山加快了反清起义的准备工作：他们不分昼夜抄写教义和宣传作品，四处散发，并结拜兄弟，广交朋友，迅速发展信徒，建立草根型的宗教组织。为了约束教众，他们以摩西十诫为范式，制定了十款天条：崇拜皇上帝；不好拜邪神；不好妄题皇上帝之名；七日礼拜颂赞皇上帝恩德；孝顺父母；不好杀人害人；不好奸邪淫乱；不好偷窃劫抢；不好讲慌话；不好起贪心。同时，规定形式多样的宗教仪式，把教众的思想、行为、日常生活方式，都纳入拜上帝教的宗教活动。这样，洪秀全通过严格的纪律和频繁多样的宗教仪式，使教众加深对皇上帝的绝对崇拜，宗教信仰则渗透到教众活动的各个层面。从而透过各级拜上帝教的组织把分散、独立的信徒组合成具有严格纪律和共同信仰的宗教团体。拜上帝教发挥了巨大的思想和组织整合功能，使贫穷、分散的农民形成一支具有统一思想和行动取向的强大政治力量。
1847 年10 月，洪秀全与冯云山在高坑冲信徒卢六家建立了拜上帝教的领导机构。他们决定向其他宗教和神权发起挑战。洪、冯首先拿香火最盛的象州甘王庙开刀，将甘王偶像砸碎，并宣布其杀母、藐视上帝等十大罪状。
洪秀全还在壁上题诗：题将草檄斥甘妖，该灭该诛罪不饶。
打死母亲干国法，欺瞒上帝犯天条。
迷缠妇女雷当劈，害累人民火定烧。
作速潜藏归地狱，腥身岂得挂龙袍！
又书《十款天条》及檄文一道帖于壁上。
洪秀全捣毁了人们一直认为很灵验的甘王神像而自己安然无恙，一时声威大振。在洪秀全、冯云山的带动下，各地拜上帝教徒向偶像发动了大规模进攻。紫荆山内及附近神庙偶像、神灵都被捣毁。
拜上帝教徒大规模地捣毁偶像，引起了地主乡绅的恐惧和仇视。他们动员团练，勾结官府，向拜上帝教众进行反扑。一场反对地主团练迫害的斗争在各基地兴起。最典型的就是秀才劣绅王作新迫害冯云山案。1848 年1 月，王督率团练以"阳为拜会，阴图谋叛"的罪名，把冯云山、卢六抓走，并与官府勾结，将二人关入桂平县监狱。洪秀全得知这个消息，急忙从贵县赶回紫荆山，设法营救，没有结果。其时，教众受到官绅团练威胁迫害，恐惧不安，人心离散，基地形势发生严重逆转。洪秀全因躲避迫害，密藏深山，难以控御全局。紫荆山区教众首领杨秀清、萧朝贵利用当地降僮巫术，诡称天父、天兄附身，预言灾难即将过去，号召教众坚持团结，度过难关，以稳住人心。同时要教众筹款集资，名曰"科炭"，以贿赂官府，营救冯云山。
不久，卢六在狱中被折磨致死，冯云山同官府进行了机智斗争。他引用儒家经典《诗经》关于敬拜上帝的话及清朝对基督教弛禁的谕令，说明"教人敬天"、"礼拜上帝"是合法行为。官府接受贿赂以后，遂判定冯云山"并无为匪不法情事"，而以"无籍游荡"为由，派差役将其"递籍管束"。冯云山说服了解差，秘密返回紫荆山。是时，洪秀全返回花县，企图运动罗孝全，通过两广总督营救冯云山。冯云山立即东行，1848 年10 月，二人在花县会面，商讨起义大计，并以1837 年洪秀全病中异梦为素材，编造了一个政治神话《太平天日》。宣称：洪秀全是上帝之子，上帝命他下凡为人间真命天子，主宰一切，为发动武装起义，建立新朝预作舆论准备。
冯云山虽然出狱，地主乡绅及团练对教众的迫害却更加严酷，平南、贵县、桂平、信宜等基地相继传来教众首领被捕入狱的信息。胡以晃、石达开、凌十八等首领则率先行动，聚众武装，痛击来犯团练。教众革命化与军事化势头异常猛烈，这使拜上帝教领导集团面临严峻的选择。
洪秀全与科场彻底决裂之后，选择了反清革命的新型道路，现在正是他最后决策走上战场的关键时刻。
（四）洪秀全与金田起义
当洪、冯返回紫荆山后，杨、萧已牢固确立对山区教众的控制。而今，洪、冯固为官绅迫害，不便公开活动，只能依恃杨、萧主持总部日常教务。于是，他们作了妥协，承认杨、萧分别为天父、天兄发言人的特殊身份，从而使中枢权力结构发生重大变化，由洪、冯一元垂直控御转化为杨、萧与洪、冯二元组合模式。杨、萧隐然凌驾于洪、冯之上，成了拜上帝教组织的主要决策人。洪秀全的行止、谋划必须得到杨、萧的同意，而且，他们还透过大父、天兄发言人的身份，主导洪秀全的行动，并直接向各基地首领发号施令。近年发现的《天兄圣旨》证实了天兄的最高决策和执行权力。
面对官绅迫害，杨、萧力持妥协，主张用"科炭"（贿赂）的手段，缩小事态，避免与官府公开对立，求得安定的政治环境，掩护起事准备。洪秀全则力主早些起义，他顶制了黄袍，准备起义登基，实现真命天子的夙愿，但被杨、萧劝止。可是，各基地教众日益剧烈的军事化和革命化的行动，使领导集团深受启迪，必须改变原来的妥协政策，加速准备和组织起义。
有诗为证：
近世烟氛大不同，知大有意启英雄。