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（3）扩大军队编制，创立新的兵种从金田到南京，太平军不断发展壮大。为适应形势需要，洪秀全逐步扩充部队编制，创立新的兵种。进军湖南之前，太平军名称有些变化。在茶地时，军长改称军帅，仍分前后左右中五大集群，分由五军主将统领，其下每大军又分一、二军，共10 军，由各军帅统带。至天京以后，五大集群又扩展为一至十军，如前军分前一至前十10 年，共50 军。其实各军并不足额，但军帅扩展到50 人。
以上为太平军的陆营编制，此外，还设立了土营和水营。
太平军至道州、郴州，吸纳了数千挖煤工人。洪秀全将他们单独编制成军，以龙山矿工老战士为骨干，组建上营，形成新的军种。设指挥一人，将军四人，其建制与陆营相同。以后不断扩大。至南京后，上营师帅达762 人。土营是太平军的工程兵，专事穴地攻城、筑路建桥。在长沙、武昌、南京发挥威力，清军尤为恐惧。至天京后，土营与木营一起，兴修王府，从事土木工程建筑等。
太平军起义之初就有船只和水军，主要用于运输，不承担战斗任务。
1852 年底克益阳时，数千船户带着民船参加太平军。在岳州，太平军又得到民船5000 只。洪秀全决定设"典水匠"一职，职同将军，以唐正财任此职，初创水营。进至武汉，沿江大小船只都为太平军所有。唐正财以船只"横江作浮桥，铁索环之"，①一夜之间建成浮桥两座，为太平军攻克武昌发挥了重要作用。唐正财因功升指挥，"总统水营船务"②。自此水营开始承担水上作战任务。太平军自武昌东下时，"船约万余只"，"蔽江而下，帆樯如雪。"③在进军金陵途中，水营在老鼠峡、东梁山两次水战中，击败清军水师，摧毁敌人江防，在战斗中发挥关键作用。围攻南京时，水营用船只一万多艘封锁江面，为攻克南京再立新功。唐正财因功擢为丞相。水师建制更加完备。
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① 《太平天国资料汇编》第1 册，页11。
② 《贼情汇纂》，《太平天国》（三），页141。
③ 《太平天国资料汇编》，页13。
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三、胜利发展 创建人间天国
（一）决策西征北伐据多种史料记载，攻克南京后，太平天国领导集团对夺取全国胜利的战略部署发生分歧。李秀成说：当时"天上与东玉尚是计及分军镇守河南，天王欲亟往河南，欲取河南为业。"看来，分兵北伐，经略河南是洪、杨一致同意的战略步骤。问题是建都地点。杨秀清早在道州就提出"专意金陵，据为根本"的战略构想，一直为洪秀全否决。而洪秀全在长沙撤围后，就主张"以河南为家"、也被杨秀清拒绝。随着水师的组建与壮大，以及南京的攻克，太平军控制长江水面优势，杨秀清专意金陵的构想而今成了现实。在建都问题上，洪秀全坚持"取河南立业"，但水营和南方将帅不愿接受，遂建议东王建都南京。这正符合杨秀清初衷。于是，他"移天王驾入南京，后改为天京。"洪秀全面对杨秀清与将帅的选择，再次让步，决定建都天京。
建都之后，根据杨秀清在道州的建议，将分兵占领长江各省，据为基地，再北伐底定中原。洪秀全则主张杨秀清镇守南京，他挥师经略河南，再直捣北京，统一全国。商讨之后，决定同时并举，分兵北伐、西征。这调和了洪、杨战略分歧，达成内部妥协。同时，也基于洪、杨的共同认识：他们都受到进军南京的形势鼓舞，高估了自己的力量，认为清军已是不堪一击。只要派出几支精兵，四面出击，就会"东无不荡，西无不除，南征无弗顺，北伐无敢违"，就能扫清残敌，"寸土皆属夭朝"。
定都不久，洪秀全令文臣撰写了《建天京于金陵论》和《贬妖穴为罪隶论》，为西征、北伐进行政治动员。
《贬妖穴为罪隶论》收集了论文32 篇，首列天王诏旨。文集以清廷盘踞的北京为"妖穴"，揭露清廷"剥削民财，竭尽民力"。北伐军要"伐暴救民，犁其廷而锄其穴"，并把直隶贬为罪隶省，向清廷发起猛烈政治攻势，为北伐夺取全国政权作舆论准备。
《建天京于金陵论》收集论文41 篇，歌颂定都金陵的决策英明正确，文集还从侧面间接论证了西证的必要性，指出长江形势"楚尾吴头"，金陵"地势稍下"，"江西安庆等省，顺流而下，运粮亦甚便易"，这就预示着必须重新回师西征，经略上游，保障天京的粮食供给，并屏障天京，开疆辟土，建立战略基地。看来，这部文集为建都与西征作了舆论准备。
1853 年5 月，洪秀全、杨秀清派林凤祥、李开芳等率军2 万人北伐，以北京为战略目标，采取永安之后的积极运动战略，"师行问道，疾趋燕都，毋贪攻城夺地糜时日。"①北伐军从扬州出发，迅速挺进安徽，6 月插入河南，占领归德（今商丘）。7 月初，于记水北渡黄河，进围怀庆（今沁阳）。9月初撤围，绕道山西，攻入直隶，克重镇临洺关。 10 月进逼天津。由于北伐军孤年深入，没有补给基地，因此，寒衣、粮食、弹药缺乏，难以继续推进。林、李一面派人向天京求援，一面被迫于1854 年初南撤至阜城待援。洪、杨闻讯于2 月组织援军北上。援军迅疾进至山东，但4 月于临清溃散南撤，被清军追堵，损失殆尽。阜城北伐军于5 月南下连镇和茬平冯官屯，继续孤守待援，至1855 年春夏分别被清军消灭。洪、杨不诺敌情，蹈袭永安以后的经验，使北伐军孤军流动作战，终于导致惨重失败，实为起义以来最大的战略失误。