希帕蒂娅在雅典留学期满又返回亚历山大里亚城，该城的行政长官聘请她到博 学园任教，讲授数学和哲学。因为她学识渊博，品德高尚，擅长修辞和雄辩，吸引 了各国学生前来听课，成为举世注目的女学者。希帕蒂娅在研究院供职斯间，除授 课之外，主要是从事科学研究，开始了创造发明的生涯。这段时间，希帕蒂娅在各 个领域都取得了研究成果，更多的成就还是在数学领域。
在教学过程中，希帕蒂娅为了帮助学生理解丢番图（Dio-phantus，约公元 246－330）的代数学，撰写了一本颇有创见的教科书。书中对丢番图的《算术》 作了评注，发展了一次方和二次方程的解法。她深入地研究了阿波罗尼斯的《圆锥 曲线论》、并对此书作了详细的注释。圆锥曲线包括椭圆、抛物线、双曲线和二次 曲线，这些重要曲线，直到17世纪才又重新引起一些著名数学家的重视和研究。除 此之外，希帕蒂娅还写过天文学专著和一些数学论文，这些论著均被遗失。到15世 纪末，在梵蒂岗图书馆发现希帕蒂娅原著的一些残页，这就成为研究她的学术思想 的重要资料。她的创造才能是多方面的，曾设计过观天仪、流体比重计和压力测试 器等仪器。
希帕蒂娅热爱科学，追求真理，主动上门求婚的哲学家、贵族子弟，都被她一 一谢绝了。她想人的一生要为社会做出贡献，现在正是埋头钻研学问的黄金时代， 不能沉溺在爱情之中，应该把爱情献给真理。因此，希帕蒂娅对每一个求婚者能意 味深长地说：“我只愿嫁给一个——他的名字叫真理”。
公元前30年，古罗马帝国侵占了埃及，亚历山大里亚从此落入罗马贵族之手。 古罗马帝国的皇帝凯撒为了加强在这块土地上的统治，利用宗教作为精神统治的工 具。当时已成为古罗马帝国的国教——基督教迅速地在这里传播开来。到公元392 年，罗马皇帝提奥多西下令拆毁希腊神庙，禁止老百姓信奉异教，由此基督教在社 会上逐渐取得统治地位。
希帕蒂娅反对迷信，不信奉基督教。她自从雅典返回家乡之后，更加笃信理性 是真知的唯一源泉。她在研究院里讲课，就宣传科学的理性主义，揭露教会的黑暗 和虚伪，在基督教徒中也产生了巨大影响。因此，基督教廷十分恐慌，视她的哲学 和数学为“异教邪说”。然而，一些正直的学者和社会人士却称赞希帕蒂娅的才华 和品格，甚至和她结下了深厚的友谊。当时亚历山在里亚城的行政长官奥伦茨就是 其中的一个，他经常来访希帕蒂娅，征询她对各种事务的处理意见。
公元412年，披着宗教外衣的阴谋家西里尔（Cyril，公元376－444）当上了 亚历山大里亚督教的大主教，他极力推行反对“异教邪说”的计划。西里尔上台后 不久，就施用各种诡计，篡夺了地方长官奥化茨的一部分权力，并借用这些权力迫 害“异己分子”。西里尔夺权的野心越来越大，深感奥伦茨，这就引起了他与奥伦 茨之间的矛盾。阴险毒辣的西里尔深知希帕蒂娅在宣传“异教邪说”，而且她与奥 伦茨有着共同的信仰和深厚的友谊，便决定先除掉希帕蒂娅。于是，西里尔到外散 布谣言，说希帕蒂娅是解决主教与行政长官之间矛盾的障碍，应该对她进行惩罚。 希帕蒂娅听到谣言之后，预感到这是不祥之兆，但并没有在压力面前屈服，而是继 续去研究院授课，传播科学思想。
公元415年3月的一天，希帕蒂娅坐着马车去研究院讲课。当马车行至一个教堂 的门口，事前由西里尔策划好的一群暴徒，迎面赶来拦截马车，把希帕蒂娅从马车 上拉下来，拖进教堂。一群教徒在牧师的指挥下，施行了惨无人道的暴行。首先把 她的衣服剥光，一根一根地拔掉她的头发，然后用锋利的蚝壳把她身上的肌肉一片 一片地割下来。最后，把还在颤动的肉体投进熊熊的烈火之中。一位才华超众、贡 献卓著的女数学家就这样遭到宗教的野蛮、残忍、无情的杀害，悲壮地离开了人间。 希帕蒂娅的死讯传到奥伦茨那里，他悲愤万分，一面惩罚了拦车杀人的凶手，一面 写报告给罗马教廷，要求调查，惩办策划者。由于罗马教廷要维护基督教的威严， 就把调查的事情一再拖延。这时西里尔的气焰更加甚嚣尘上，千方百计地阻止调查。 奥伦茨发现势头不对，被迫离开了亚历山大里亚，流亡国外。后来，罗马教廷为了 掩人耳目，制造谎言，由罗马大主教宣布说：“此案查无实据，据传希帕蒂娅在雅 典，并没有发生任何悲剧”。一桩骇人听闻的惨杀案，就这样消声匿迹了。
女数学家希帕蒂娅之死，能给我们一些什么样的启示呢？首先，宗教神学是科 学大敌。因为神学的本质是唯心论，它主张精神第一，上帝万能，既不尊重客观事 实，也不接受实践的检验。而科学却恰恰相反，它是揭示自然界和人类社会各种现 象的本质和规律，是不容许存在半点虚伪和谎言的，它毫不掩饰地揭露宗教神学的 反动本质。科学上的每一个发现，都是对宗教迷信的一次打击。因引，宗教神学必 然要疯狂地反对科学。其次，科学家必须具有为真理而献身的精神。宗教神学一旦 成为统治阶级的工具，科学就会受到严重的摧残。希帕蒂娅由于冲破了神学的禁锢， 追求科学的睦理，教廷便向她伸出魔爪。希帕蒂娅在残酷的迫害面前不屈服、不妥 协，最终为维护真理献出了宝贵的生命。宗教的火刑场虽然焚烧了科学家的躯体， 但不能泯灭科学真理的光辉，科学发展到今天，已经形成一个庞大的体系，正在不 断地造福于人类。
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