适逢知县覃瀚元之侄患头风之症，延请洪仁玕诊治，未久痊愈。洪仁玕得到了一笔酬金，并被推荐到罗田县衙任文案。但知县还未到任，而且，江南大营清军围困天京甚紧，洪仁玕无心留在罗田，遂扮商人，购货乘船，于1859 年3 月13 日驶向天京。4 月21 日终于抵达，见到了分别已有九载的洪秀全。从此揭开他一生中最光辉的篇章。
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② 《洪仁玕自述》，《太平天国》（二），页841。
③ 《洪仁玕自述别录之一》，《洪仁玕选集》，中华书局，1978 年版，页80。
④ 呤唎，《太平天国革命亲历记》，页175。
① 《洪仁玕自述》，《太平天国》（二），页846。
② 《洪仁玕自述》，《太平天国》（二），页846。
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三、总理朝纲 推行新政
天京是太平天国都城，是政治、宗教和军事中心。洪仁玕立刻感受到一种迥然不同于广州、香港、上海等城市的气氛。尤其与久别的族兄洪秀全重逢，两人心情都非常激动，"彼此悲喜交集"③。其时，正是太平天国运动度过严重危机，有所振兴的关键时刻。
1856 年9 月，由于领导集团的权力斗争引发了自相残杀的天京内讧，持续了几近一年。结果，东王杨秀清、北王韦昌辉、燕王秦日纲相继被杀，翼王石达开率部队出走分裂。首义诸王只剩下洪秀全一人。内讧中，二万将士惨遭杀害，数万将士脱离中央远征。太平天国由盛而衰，形势逆转。清军乘机转入反攻，上游湖北、江西先后沦丧，下游镇江、瓜州失陷，天京第二次被围。面临敌军的强劲攻势，太平天国"朝中无将，国中无人"，"人心改变，政事不一，各有一心"，经历着空前危机。①在天京事变后的艰难日子中，天王洪秀全决定自任军师，下令甄选新秀，擢拔蒙得恩、陈玉成、李秀成、李世贤等组成新的领导核心，辅佐天王，协理军政。
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③ 《洪仁玕自述别录之二》，《洪仁玕选集》。
① 《李秀成自述》，《太平天国文书汇编》，页491。
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1858 年夏，陈玉成、李秀成在枞阳大会各路将帅，组建联军，攻克庐州（今合肥市），在皖北首先取得突破。秋天，太平军二破江北大营，打通长江航道，恢复天京接济，大大振奋军心。11 月，陈玉成、李秀成再次挥戈援皖，在三河镇重创湘军，痛歼其精锐李续宾部，并乘胜收复皖北失地，稳定了西线局势。皖南李世贤也在湾址镇歼灭江南大营悍将邓绍良、戴文英二部，取得重大战果。当洪仁玕赴天京时，太平天国虽然走出军事低谷，出现振兴迹象，但形势仍不容乐观。江南大营清军持续围困天京，而且接管江北军事，同时，捻军首领李昭寿、薛之元相继叛变，江浦失守，浦口被围，天京江路接济重新受到威胁。李秀成、陈玉成先后援京，与清军鏖战江北，未决胜负。湘军乘机恢复元气，再度侵扰鄂皖边界，威胁皖北腹地安全。因此，太平天国继续处于东西两线作战的不利态势，一时难以改变困难局面。
就政治层面而言，内讧的结果使洪秀全排除了首义诸王，牢固控制了太平天国最高领导权。他自兼军师，把决策、行政、军事等权力全部集中到自己手里。虽然重新封授了五军主将，令蒙得恩辅佐朝政，陈玉成、李秀成指挥军事，但他们只是执行洪秀全的决策和诏旨，而不能独立处理军政事务，更不能参与重大军政决策。而且，自天京事变后，洪秀全不愿信用异姓文武，一度宠信两位庸懦贪劣的兄长洪仁发、洪仁达，由他们揽持朝政。李秀成等文武强烈抵制和反对，迫使洪秀全不得不罢黜这二位兄长。洪秀全的精力和时间有限，太平天国又处在艰苦的战争环境，他很难包揽从决策到实施的权力运作，亟需一位才智学识出众、办事干练严谨、而又值得信赖的亲贵担任军师，以分担自己沉重的军政工作。因此，洪仁玕的来临，使洪秀全喜出望外。
天王看到洪仁玕历经磨难，始终忠诚太平天国；学识渊博，兼涉中西，对政治、经济、宗教、天文、历数都有造诣；而且这位族弟自幼崇敬和追随自己，又是拜上帝教的最早创始者之一，无疑是总理朝政的最佳人选。洪秀全立即封洪仁玕为福爵，半个月以后，又封义爵加主将，已与蒙得恩地位相等。当时，太平天国设立义、安、福、燕、豫、侯六等爵位，洪秀全曾宣布永不封王，义爵实是最高爵位。5 月11 日，洪秀全又破例封洪仁玕为"开朝精忠军师顶天扶朝纲干王"，并"降诏天下，要人悉归其制"。①这样洪仁玕在到天京不到20 天时间内，因天王"不避朝贵"、"恩加叠叠"，①连续三次加封，以"板荡忠臣"期许，膺以太平天国军政大权的重任，确乎非同寻常。这种破格的信宠使洪仁玕既深怀感激图报的忠诚，又产生无功受禄的不安心态。